博物馆陈展共分为4个展厅，32个单元。近年来，我县以全面提高城市综合服务功能，打造生态宜居，历史文化突出的精品城市为奋斗目标，不断加大文化基础设施投入，完善城市形象，提升博物馆品位，目前博物馆为自治区干部教育培训基地、自治区科普示范教育基地、昌吉州民族团结教育示范点、昌吉州研学教育基地、吉木萨尔县党史教育示范点等，极大满足群众的文化需求，城市发展日益崛起，群众对历史文化获得感满满。
吉木萨尔县博物馆占地面积800平方米。吉木萨尔县文博中心大楼是一座大型的融北庭鲜明的区域文化与盛唐历史文化于一体的仿古建筑，也是县内最大的一所综合性服务机构，内设三个中心、四个展馆。吉木萨尔县博物馆就位于该文博中心大楼四楼。
吉木萨尔县博物馆的藏品多以抢救性出土、征集和捐赠等方式获得。吉木萨尔县博物馆的藏品按材质划分为金属器类、陶瓷类、石器类、竹木器物、玉器类等，钱币则单独划分。据中国博物馆志显示，吉木萨尔县博物馆有藏品546件，其中金属器物104件，陶瓷器物170件，其余为石、玉、竹木器物。钱币共计256枚。 [2]截至2019年末，吉木萨尔县博物馆的藏品数量为1514件/套，其中珍贵文物20件/套。